材料與方法的選擇
(一)材料與方法的選擇
臨床常見的標(biāo)本有血液,尿液,唾液,組織及培養(yǎng)細(xì)胞等;核酸分離與純化的方法非常多,如何恰當(dāng)?shù)厥占c準(zhǔn)備材料,選擇適宜的分離與純化方法是一個首要的問題。首先我們應(yīng)當(dāng)明確核酸的分離與純化并不是zui終的目的,不同的實驗研究與應(yīng)用對核酸的產(chǎn)量,完整性,純度和濃度可能有不同的要求;至于分離與純化核酸所需的時間與成本也往往需要考慮;在不影響核酸質(zhì)量的情況下,應(yīng)選擇安全無毒的試劑與方案。近年來,有關(guān)試劑盒的開發(fā)與自動化儀器的使用,能批量制備核酸樣品,大大提高了分離與純化的效率。
(二)選擇的原則
核酸分離與純化的方法很多,應(yīng)根據(jù)具體生物材料的性質(zhì)與起始量,待分離核酸的性質(zhì)與用途而采取不同的方案。無論采取何種方法,都應(yīng)遵循總的原則:一是保證核酸一級結(jié)構(gòu)的完整性,因為完整的一級結(jié)構(gòu)是核酸結(jié)構(gòu)和功能研究的zui基本的要求;二是盡量排除其它分子的污染,保證核酸樣品的純度,這是本章討論的主要內(nèi)容。
(三)核酸完整性的保持
為了保證核酸的完整性,在操作過程中,首先應(yīng)盡量避免各種有害因素對核酸的破壞。影響核酸完整性的因素很多,包括物理,化學(xué)與生物學(xué)的因素,其中有些是可以避免的。如過酸或過堿,對核酸鏈中的磷酸二酯鍵有破壞作用,在核酸的提取過程中,采用適宜的緩沖液,始終控制pH在4~10之間,就可以很好地避免其危害;另外如高溫加熱,除高溫本身對核酸分子中的化學(xué)鍵的破壞作用外,還可能因煮沸帶來液體剪切力,因此核酸提取常常在0~4℃的條件下進行。
其次對無法避免的有害因素,應(yīng)采取多種措施,盡量減輕各種有害因素對核酸的破壞。應(yīng)盡量簡化分離純化的步驟,縮短提取的時間,減輕各種有害因素對核酸完整性的破壞;DNA酶(DNase或DNAase)的激活需要Mg2+,Ca2+等二價金屬離子,若使用EDTA,檸檬酸鹽并在低溫條件下操作,基本上就可以抑制DNA酶的活性。RNA酶(RNase或RNAase)的廣泛存在與不易失活的特點,決定了生物降解是RNA提取過程中的主要危害因素。